Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc27a5Q4LDG0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc27a5Q4LDG0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc27a5Q4LDG0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc27a5Q4LDG0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Slc27a5Q4LDG0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Slc27a5Q4LDG0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Slc27a5Q4LDG0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Slc27a5Q4LDG0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc27a5Q4LDG0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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