Protein–RNA interactions for Protein: Q499E6

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q499E6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q499E6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms