Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

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Length 702 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Zfp235Q499D5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Zfp235Q499D5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Zfp235Q499D5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp235Q499D5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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