Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa20Q45VN2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms