Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Carmil2Q3V3V9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms