Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc110Q3V125 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms