Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms