Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms