Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZY0

Sfi1, Protein SFI1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfi1Q3UZY0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sfi1Q3UZY0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfi1Q3UZY0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms