Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc160Q3UYG1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms