Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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Kdm5aQ3UXZ9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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Kdm5aQ3UXZ9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm5aQ3UXZ9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
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