Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pfdn4Q3UWL8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pfdn4Q3UWL8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pfdn4Q3UWL8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pfdn4Q3UWL8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pfdn4Q3UWL8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pfdn4Q3UWL8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pfdn4Q3UWL8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pfdn4Q3UWL8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pfdn4Q3UWL8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms