Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm27235Q3UW50 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms