Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Clpsl2Q3UW21 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms