Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D130052B06RikQ3UW13 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms