Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms