Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap1Q3UUV5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms