Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Znf48Q3US17 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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Znf48Q3US17 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf48Q3US17 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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