Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp560Q3URI6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms