Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms