Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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