Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Rnf224Q3UIW8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Rnf224Q3UIW8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Rnf224Q3UIW8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rnf224Q3UIW8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rnf224Q3UIW8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf224Q3UIW8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf224Q3UIW8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf224Q3UIW8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf224Q3UIW8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf224Q3UIW8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf224Q3UIW8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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Rnf224Q3UIW8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf224Q3UIW8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf224Q3UIW8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf224Q3UIW8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Rnf224Q3UIW8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf224Q3UIW8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf224Q3UIW8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf224Q3UIW8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf224Q3UIW8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf224Q3UIW8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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