Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitpnm3Q3UHE1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms