Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Garem1Q3UFT3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Garem1Q3UFT3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms