Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDN3

Gm45902, Predicted gene 45902, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45902Q3UDN3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm45902Q3UDN3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm45902Q3UDN3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm45902Q3UDN3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm45902Q3UDN3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm45902Q3UDN3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm45902Q3UDN3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm45902Q3UDN3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm45902Q3UDN3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm45902Q3UDN3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm45902Q3UDN3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm45902Q3UDN3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm45902Q3UDN3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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