Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms