Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms