Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U6N9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Q3U6N9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Q3U6N9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U6N9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U6N9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U6N9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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