Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ulk3Q3U3Q1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ulk3Q3U3Q1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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