Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gse1Q3U3C9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms