Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam193bQ3U2K0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms