Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1J0

Slc38a5, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a5Q3U1J0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc38a5Q3U1J0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc38a5Q3U1J0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms