Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms