Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms