Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc28Q3TX51 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms