Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms