Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms