Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nlrp4cQ3TKR3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms