Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc13Q3TIR1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc13Q3TIR1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.9 ms