Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms