Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap5b1Q3TAP4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms