Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccbe1Q3MI99 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccbe1Q3MI99 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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