Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Cpne9Q1RLL3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne9Q1RLL3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms