Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Fam171bQ14CH0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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