Protein–RNA interactions for Protein: Q149T7

Ppm1j, Protein phosphatase 1J, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1jQ149T7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppm1jQ149T7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms