Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd2Q149F1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms