Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Spatc1Q148B6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Spatc1Q148B6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Spatc1Q148B6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms