Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms