Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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