Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc45a4Q0P5V9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc45a4Q0P5V9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms